Берт Хеллингер родился в 1925 году в Германии. Ещё до Второй мировой войны, школьником, собирался стать миссионером. В 1942 был призван в стройбат Вермахта. В конце войны Берт попал в плен к Союзникам.

После войны завершил своё теологическое образование и отправился в Южную Африку вести миссионерскую деятельность среди зулусов. Он стал священником католического ордена и руководил школой в Южной Африке. Там он впервые познакомился с методами групповой психотерапии, причем с англо-американским стилем групповой работы, полностью ориентированным на практическое применение. (Психологи приехали улаживать конфликты на расовой почве, нередкие в группах учеников смешанного расового состава.) Видимо именно оттуда берёт начало приверженность Хеллингера к феноменологии и практической психотерапевтической работе. Хеллингер не ограничился «знакомством» с методом, он его освоил и стал вести терапевтические группы. В Европу Хеллингер вернулся только в 1969 году.

Вскоре он познакомился с гештальт-терапией, затем начал обучаться в Вене психоанализу. К этому же периоду относится его выход из католического ордена. Знакомство с книгой Янова «Первичный крик» привело Берта Хеллингера в конечном счете к тому, что он так и не стал аттестованным психоаналитиком.

Во время увлечения сценарным анализом Хеллингер неожиданно для себя обнаружил, что несколько поколений семьи обладают свойствами системы, и между поколениями могут передаваться послания, и эта передача не обусловлена ничем, кроме факта принадлежности к системе.

Берт Хеллингер постоянно что‑то изучал, часто при первой же возможности применяя полученные знания. Из такого собирания, осваивания в терапевтической работе и обобщения знаний, умений, пониманий и рождался метод Хеллингера.

Самое интересное, что при том, что сам Хеллингер был прежде всего нацелен на практическую работу и скептически относился к изложению своего метода на бумаге, обобщенно сформулированные основы его метода впервые стали публично доступны через книгу Вебера «Кризисы любви».